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BLAST中blastx和tblastx的区别有哪些(blastn和blastp的区别)

请教下NCBI中blastn和p,x还有tblastn,x有什么区别

blastn 是用DNA序列去检索其匹配序列时的选项,告诉程序你的序列是核酸序列,你希望检索核酸库,是最常用的一种检索方式。

balstp是用蛋白序列去检索时的选项。blastx是你希望数据库把你提交的序列去同时检索DNA库和蛋白库。tblastn是你提交的是DNA序列,你希望程序自动将其翻译后去检索相匹配的蛋白序列。所以,选择什么检索方式是根据你提交的序列种类和你希望检索出来的序列种类来决定的。

Nonber是什么意

blast 的全称是 basic local alignment search tool 是一种极其常见的序列比对工具。其中包含几个模块(可以这么认为),blastn blastp blastx,tblastx 等等。blastp 用于蛋白序列之间的比对。

BLAST中blastx和tblastx的区别有哪些(blastn和blastp的区别)-图1

ncbiblast使用教程

NCBI BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一种用于比对生物序列的工具,可以在NCBI的网站上免费使用。以下是NCBI BLAST使用教程:

1. 进入NCBI BLAST页面。可以通过搜索“NCBI BLAST”或者直接打开https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi来访问NCBI的BLAST在线工具。

2. 选择数据库。在NCBI BLAST页面中,可以看到多个数据库选项,可以根据自己所需要的序列类型选择不同的数据库。

BLAST中blastx和tblastx的区别有哪些(blastn和blastp的区别)-图2

3. 输入查询序列。在“Enter Query Sequence”中输入查询序列,可以直接输入序列、上传FASTA格式文件或者使用NCBI的ID。

4. 选择程序和参数。根据需要选择程序和参数,常用的有blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx等。

到此,以上就是小编对于blastn和blastp的区别的问题就介绍到这了,希望介绍的3点解答对大家有用,有任何问题和不懂的,欢迎各位老师在评论区讨论,给我留言。

BLAST中blastx和tblastx的区别有哪些(blastn和blastp的区别)-图3
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